Što treba znati
- FNA datoteka je FASTA format DNK i datoteka za usklađivanje sekvence proteina.
- Otvorite jedan s Geneiousom.
- Pretvorite u FASTA i slične formate s istim programom.
Ovaj članak objašnjava što je FNA datoteka, kako je otvoriti i kako je spremiti u drugi format kao što je FASTA, GB, VCF, slike itd.
Što je FNA datoteka?
Datoteka s datotečnim nastavkom FNA je FASTA format DNA i datoteka za usklađivanje sekvenci proteina koja pohranjuje informacije o DNK koje može koristiti softver za molekularnu biologiju.
FNA datoteke, konkretno, mogu se koristiti samo za čuvanje informacija o nukleinskoj kiselini, dok drugi FASTA formati sadrže druge informacije povezane s DNK, poput onih s FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET ili AA ekstenzije datoteka.
Ovi FASTA formati temeljeni na tekstu izvorno su proizašli iz softverskog paketa s istim nazivom, ali se sada koriste kao standard u aplikacijama za usklađivanje sekvenci DNK i proteina.
FNA se također odnosi na neke tehnološke pojmove koji nemaju nikakve veze s ovim formatom datoteke, kao što je konačno mrežno prihvaćanje, mogućnost proširenja naziva datoteke/atributa, Fujitsu mrežna arhitektura i brzo oglašavanje susjeda.
Kako otvoriti FNA datoteku
Otvorite jedan u sustavu Windows, macOS i Linux uz Geneious (besplatno je 14 dana). Da biste to učinili, idite na File > Import izbornik i odaberite uvoz datoteke putem From Filestavka izbornika.
Možda ga možete otvoriti i pomoću BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Isprobajte Notepad++ ili neki drugi uređivač teksta ako te ideje ne funkcioniraju. Datoteka doista može biti tekstualna i jednostavna za čitanje, ili možete otkriti da nema nikakve veze s FASTA formatom, u kojem slučaju otvaranje datoteke kao tekstualnog dokumenta može otkriti tekst koji identificira što je korišteno za stvaranje datoteke ili u kojem je formatu datoteka.
Kako pretvoriti FNA datoteku
Ne možemo to potvrditi jer to nismo isprobali, ali trebali biste moći koristiti Geneious za pretvaranje datoteke u mnoge druge formate, kao što su FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV i VCF. To se može učiniti putem Datoteka > Izvoz izbornika programa.
Taj isti program također bi trebao moći spremiti datoteku u PNG, JPG, EPS ili PDF putem File > Save As Image File.
Iako obično ne možete samo preimenovati ekstenziju datoteke u nešto drugo i očekivati da će raditi na isti način, možete preimenovati datoteku. FNA u datoteku. FA ako će vaš određeni softver za sekvenciranje DNK prepoznati samo FA format.
Umjesto preimenovanja datotečnih ekstenzija, trebali biste upotrijebiti besplatni pretvarač datoteka za pretvaranje drugih vrsta datoteka. U slučaju FNA i FA datoteka, događa se da će neki programi otvoriti samo datoteke koje imaju FA datotečni nastavak, u kojem bi slučaju preimenovanje trebalo dobro funkcionirati.
Još uvijek ne možete otvoriti?
Ako nakon korištenja gore navedenih programa i dalje ne možete otvoriti svoju datoteku, možda ćete otkriti da ekstenzija datoteke zapravo ne čita. FNA, već nešto što samo izgleda slično.
Na primjer, FNG (Font Navigator Group) datoteke užasno izgledaju kao da piše ". FNA", ali ako bolje pogledate, samo su prva dva slova ista. Budući da su datotečne ekstenzije različite, to je pokazatelj da su različitog formata datoteke i najvjerojatnije neće raditi s istim programima.
Isto bi se moglo reći za mnoge druge ekstenzije datoteka kao što su FAX, FAS (kompilirani AutoLISP s brzim učitavanjem), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue funkcije) i FND (Windows spremljeno pretraživanje).
Ovdje je ideja samo provjeriti da ekstenzija datoteke glasi. FNA. Ako se dogodi, pokušajte ponovno upotrijebiti gore navedene programe da biste ga otvorili ili pretvorili. Ako imate drugu vrstu datoteke, istražite njeno proširenje kako biste saznali koje su aplikacije potrebne za njeno otvaranje ili pretvaranje.
FAQ
Kako otvoriti FNA datoteku u Pythonu?
Prvo pretvorite FNA datoteku u FASTA format pomoću aplikacije treće strane kao što je Geneious. Zatim možete preuzeti Biopython, skup besplatno dostupnih alata za biološko računanje za rad u bioinformatici. Na kraju, upute o radu s FASTA datotekama potražite u Biopython Tutorial and Cookbook.
Kako mogu pronaći svoje FNA maker brojeve u Ancestry raw datoteci?
Možete preuzeti većinu DNK podataka s Ancestry.com u.txt formatu. Međutim, samo korisnici čija je DNK analizirana sekvenciranjem sljedeće generacije (NGS) imaju opciju preuzimanja VCF datoteke. Da biste preuzeli VCF datoteku, morate biti vlasnik DNK, imati DNK testiranje pomoću NGS tehnologije i imati najmanje 350 MB slobodnog prostora na svom uređaju.